کلیدی‌ترین تمایز، الگوی زمانی تغییرات خلق است. در اختلال دوقطبی نوع دو، دوره‌های هیپومانیا مشخص و پایدار برای چند روز متوالی وجود دارد، در حالی که در اختلال شخصیت مرزی نوسانات خلقی معمولاً در پاسخ به رویدادهای بین‌فردی و در بازه‌ی ساعتی رخ می‌دهند. شرح حال طولی و اطلاعات جانبی از خانواده در این افتراق بسیار کمک‌کننده است.